Ripley'in (Sigourney Weaver) Fiorina 161'e yaptığı son fedakarlıktan bu yana tam 200 yıl geçmiştir. Uzun yıllar boyu yapılan başarısız deneylerden sonra bilimadamları Ripley ve o öldüğünde içinde olan kraliçe yaratığın bir kopyasını klonlamayı başarmışlardır. Bilimadamlarının yaratık bir taşıyıcı buluncaya kadar fark etmekte geç kaldığı bir gerçek vardır : Bu yeni tür yaratık kendisinden öncekilerin aksine çok daha zekidir.